W ciągu pierwszego roku swojej działalności Nowacka zainicjowała wiele zmian, które okazały się nieprzemyślane i destrukcyjne. Jednym z kluczowych elementów jej polityki było usunięcie z programu nauczania przedmiotów i treści uznawanych za istotne dla polskiej tradycji i patriotyzmu, w tym historii i teraźniejszości oraz wychowania do życia w rodzinie. Głośnym echem odbija się jej atak na książkę HIT prof. Wojciecha Roszkowskiego, którego obraziła na tyle, że zapowiedział podjęcie kroków prawnych przeciwko niej.

Nowa minister wprowadziła także niemal całkowitą likwidację zadań domowych, co spotkało się z krytyką nauczycieli i rodziców, a także zapowiedziała redukcję lekcji religii.

Działania Nowackiej wzbudziły szerokie kontrowersje i sprzeciw, a ich efekty – według wielu ekspertów – mogą mieć długotrwałe, negatywne konsekwencje dla jakości polskiej edukacji.